ワキガの原因は一言で言うとアポクリン汗と細菌が脂肪を分解するときにワキガの臭いをだします。
ワキにはエクリン汗腺とアポクリン汗腺という汗を出す２種類の器官と皮脂腺という脂肪分を出す器官があります。
それぞれの器官について説明しますとエクリン汗腺は全身にあり、体温の調整をするために１日２リットルの汗を出しています。成分的には99％水で残りの１％ほどが塩で構成されていますので、汗が少々しょっぱいのはこのせいです。
皮脂腺は毛の生えている部分にしかなく毛根の所にある器官です。この皮脂腺は毛や皮膚に油分を供給するために脂肪成分の分泌物を出しています。
エクリン汗は皮脂腺から出た脂肪成分を全身に広げ、天然のクリームとするような役割も持っています。アポクリン汗腺ですが、毛の密集しているワキ・局部などにしかありません。その役割ですが、皮脂腺の補助機関である脂腺のサポートになります。脂腺は体内にある脂肪成分などの油分を代謝（排出）させていますが、この器官でその代謝が間に合わなくなる場合があります。その場合、補助機関であるアポクリン汗腺を通じて、アポクリン汗として代謝させているわけです。
各器官は、このような役割を持っていますが、ワキガはこの３つの器官の分泌物が相互に影響しあって強烈なわきが臭になっています。直接の臭いの元であるアポクリン汗ですが、この汗は多少粘りがあって排出すると通常すぐ乾いてしまいます。
しかし、体温の上昇などでエクリン汗がワキから多量に出るとアポクリン汗と交じり合ってワキ全体にアポクリン汗が広がってしまい、アポクリン汗の臭いも広がってしまいます。また、ワキには毛が密集していて、微小細菌が繁殖するには絶好の場所になっています。この微小細菌は皮脂腺から出る脂肪成分を酵素によって分解していますが、このときに強い臭いを発します。高カロリーの食生活を続けていれば皮脂腺から出る脂肪成分も多い状態になり、たくさんの脂肪成分を分解することになりますのでそれだけ強いワキガ臭になります。
この「分解臭」と「アポクリン汗」の臭いが混じり強烈なワキガ臭となるのです。